モニタリングサイト1000の成果は、国や地方自治体による環境行政、民間企業が行う環境アセスメント調査、研究者の学術論文の作成、市民団体の教育・普及活動などに活用されています。
| 行政 |
環境省 |
政策決定・各種計画への活用 |
- 生物多様性国家戦略
- 生物多様性条約に基づく国別報告書
- 生物多様性及び生態系サービスの総合評価（JBO）
- 環境白書
- 気候変動影響評価報告書及び気候変動意見具申
- 国立公園管理運営計画（大雪山国立公園）
- 国土強靭化年次計画
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| 保護地域等の指定・見直し |
■ ラムサール条約湿地登録
- 登録時の根拠データとして使用
荒尾海岸、与那覇湾（2012登録）、東よか干潟（2015登録）、葛西臨海公園（2018登録）、志津川湾（2018登録）、猪苗代湖（2025登録）
- 登録後の管理においても活用
シギ・チドリ類：144サイトのうち、14サイトがラムサール条約湿地として登録（2019年度時点）
ガンカモ類：81サイトのうち、25サイトがラムサール条約湿地として登録（2019年度時点）
■ 鳥獣保護区指定・見直し
- 福島潟鳥獣保護区（2014更新）、大山鳥獣保護区（2017更新）、三貫島鳥獣保護区（2021更新）、日出島鳥獣保護区（2021更新）などに陸生鳥類調査、ガンカモ類調査、小島嶼（海鳥）調査等の結果を活用
■ 国立公園の指定・管理
- 特別保護地区、海域公園地区などの保全管理状況の把握
例）高山帯における盗掘や踏み荒らしなどの人為的な影響（南アルプス国立公園など）、サンゴ白化現象等の現況（霧島錦江湾国立公園）、土砂流出によるサンゴ群集への影響（石垣西表国立公園など）
- 自然公園法における指定植物の検討（上信越高原国立公園）
■ 自然共生サイトの認定
- モニ1000サイトから自然共生サイトに認定された箇所 19サイト（2025年3月時点）
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| 世界自然遺産地域の管理 |
■ 白神山地
陸生鳥類のデータを使用し、ブナ林における動植物の多様性が適切に保護されているかを把握
■ 小笠原諸島
保全状況の主要指標として、森林草原調査、海鳥調査を使用
■ 知床
海域管理計画定期報告書では、海鳥類の営巣状況の把握のため海鳥調査のデータを活用
評価・管理の一環であるモニタリング調査の一部として活用
高山域における気象観測システム設置検討において、高山帯調査マニュアルを参照
■奄美大島、徳之島、沖縄島北部及び西表島
気象変化と動物相の変化の指標の一つとして、森林・草原調査及び陸生鳥類調査の結果を活用
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| 「生物多様性の観点から重要度の高い場所」の抽出 |
■重要湿地
2016年の見直しでは、45湿地について本業務の調査成果を使用
■重要里地里山
選定された600か所のうち、57か所でモニタリングを実施
■重要海域
ガンカモ類・シギ・チドリ類・海鳥調査のデータを使用
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| 野生動植物の保全管理 |
■希少種保全
- レッドリスト改定（シロチドリ（VU）、アカヤマドリ（NT）、オオセグロカモメ（NT）などコアホウドリ、クロコシジロウミツバメ、ヒメクロウミツバメ、オーストンウミツバメ）
- 希少種保全のための生息（餌）環境の評価（ケナガネズミ、オキナワトゲネズミ）
- モニ1000調査による再発見を契機とした保全事業の実施（カラフトグワイ）
- 保護増殖事業（エトピリカ、ウミガラス）
- キタダケソウ生育地保護区における防鹿柵設置（南アルプス国立公園）
- 海鳥繁殖地への立入自粛区域の設定（慶良間諸島国立公園）
- 生息地保全対策（海鳥生息地の土留め対策）（日出島）
■外来種、移入種等対策
- 外来生物の防除（アライグマ、ブルーギル、外来植物など）
- セイヨウオオマルハナバチの監視手法の作成（大雪山）
- ドブネズミ駆除（ユルリ・モユルリ島、沖ノ島・小屋島・星神島）
- ネコの島外移送（天売島、御蔵島）
■野生鳥獣対策
- 捕獲制限や狩猟鳥獣の指定解除等の見直し（バン、タシギ）
- シカ食害の影響把握による個体数管理、防鹿柵の設置や研究（芦生（京都府）、秩父大山沢（埼玉県）など）
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| その他 |
- 二国間渡り鳥等保護条約会議でのシギ・チドリ類調査、小島嶼調査の情報提供
- 気候変動適応情報プラットフォーム（A-PLAT）での掲載
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| 地方自治体 |
条例・各種計画の策定・改定 |
- 生物多様性地域戦略（青森県（2025-2030）、茨城県つくば市（2025-2034）、千葉県千葉市、千葉県船橋市、千葉県流山市、山梨県、京都府京都市（2021-2030）、熊本県熊本市）
- 生物多様性保全計画（北海道）
- 環境白書（石川県）
- 環境基本計画（群馬県桐生市（2021-2030）、千葉県船橋市、鹿児島県姶良市）
- その他（横須賀市みどりの基本計画、海上の森保全活用計画2025（愛知県）、地球温暖化対策実行計画（鹿児島県）、サンゴ礁保全再生総合対策事業（沖縄県）、宮古島志エコアイランド推進計画（沖縄県））
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| 保護地域の指定・見直し |
- 沖縄県指定鳥獣保護区の新設（米須海岸、翁長干潟など）
- 大阪府指定鳥獣保護区の検討（箕面鳥獣保護区）
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| 野生動植物の保全管理 |
■希少種保全（レッドデータブックの改定等）
- 都道府県レッドデータブック改定（岩手県、福島県、栃木県、東京都、石川県、山梨県、島根県、愛媛県、高知県、福岡県、沖縄県）
- 市区町村レッドデータブック改定（長野県安曇野市、滋賀県甲賀市、大阪府堺市）
- 保全活動、保全施策への活用（山梨県、京都府南丹市、沖縄県国頭村、沖縄県宮古島市）
■外来種対策
- アライグマ対策（神奈川県、北海道帯広市、茨城県土浦市、大阪府枚方市など）
- 外来植物の駆除（京都府長岡京市、兵庫県淡路市）
- 「生態系被害防止外来種リスト」の作成（長野県）
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| 企業 |
CSR、環境アセスメント |
■環境アセスメント、CSR、教育・普及啓発、自然共生サイト |
| 学術研究（研究者等） |
学術論文、学会発表等 |
■学術論文等の執筆 |
| 普及啓発（メディア） |
新聞やニュース等のメディアでの紹介 |
■新聞等のメディアでの紹介 |
| 学術研究（研究者等） |
国際的取り組みとの連携 |
■国際的取組との連携（データ提供、共同研究） |
