| コード 番号 | 魚 種 名 | 学 名 | 種略号 |
| 1 | イ ト ウ | Hucho perri (BREVOORT) | Hp |
| 2 | オ シ ョ ロ コ マ | Salvelinus malma (WALBAUM) | Sm |
| 3 | ゴ ギ | Salvelinus imbrius JORDAN et McGREGOR | Si |
| 4 | イ シ カ リ ワ カ サ ギ | Hypomesus olidus (PALLAS) | Ho |
| 5 | アリアケヒメシラウオ | Neosalanx regani WAKIYA et TAKAHASI | Nr |
| 6 | アリアケシラウオ | Salanx ariakensis KISHINOUYE | Sa |
| 7 | ウ ケ ク チ ウ グ イ | Tribolodon sp | Tsp |
| 8 | ヒ ナ モ ロ コ | Aphyocypris chinensis GUNTHER | Ac |
| 9 | イ タ セ ン バ ラ | Acheilognathus longipinnis REGAN | Al |
| 10 | ニッポンバラタナゴ | Rhodeus ocellatus smithi (REGAN) | Ros |
| 11 | カ ゼ ト ゲ タ ナ ゴ | Rhodeus atremius JORDAN et THOMPSON | Ra |
| 12 | スイゲンゼニタナゴ | Rhodeus suigensis (MORI) | Rs |
| 13 | ミ ヤ コ タ ナ ゴ | Tanakia tanago TANAKA | Tt |
| 14 | ゼ ニ タ ナ ゴ | Pseudoperilampus typus BLEEKER | Pt |
| 15 | イ シ ド ジ ョ ウ | Cobitis takatsuensis MIZUNO | Ct |
| 16 | ア ユ モ ド キ | Leptobotia curta (TEMMINCK et SCHLEGEL) | Lc |
| 17 | ネ コ ギ ギ | Coreobagrus ichikawai OKADA et KUBOTA | Ci |
| 18 | イトヨ（陸封型・降海型） | Gasterosteus aculeatus aculeatus LINNAEUS | Ga |
| 19 | ハ リ ヨ | Gasterosteus aculeatus microcephalus GIRARD | Gm |
| 20 | ト ミ ヨ | Pungitius sunensis (GUICHENOT) | Ps |
| 21 | ム サ シ ト ミ ヨ | Pungitius sp | Psp |
| 22 | イ バ ラ ト ミ ヨ | Pungitius pungitius (LINNAEUS) | Pp |
| 23 | エ ゾ ト ミ ヨ | Pungitius tymensis (NIKOLSKY) | Pi |
| 24 | オ ヤ ニ ラ ミ | Coreoperca kawamebari TEMMINCK et SCHLEGEL | Ck |
| 25 | ヤ マ ノ カ ミ | Trachidermus fasciatus HECKEL | Tf |
| 26 | カ マ キ リ | Cottus kazika JORDAN et STERKS | Ckz |
| 27 | タ ナ ゴ モ ド キ | Hypseleotris bipartita HERRE | Hb |
（注） イトヨは陸封型と降海型のものを区別した。